Fen Bilimleri Enstitüsü 3 Temmuz 1992 yılında kurulmuş olup; ilk kez 1993-1994 eğitim-öğretim yılı bahar yarıyı öğrenci alımı yapılarak eğitime başlanmıştır. Enstitümüz, Mühendislik Fakültesi, Fen Edebiyat Fakültesi ve Eğitim Fakültesinin Fen ve Matematik alanlarında Lisansüstü eğitim verilmekte olup, halihazırda 16 Yüksek Lisans ve 11 Doktora Programı ile eğitim-öğretim faaliyetlerine devam etmektedir.